Pois, se veio aqui para é porque já tentou isto (Importar FLV para o iTunes), certo?
O que aconselho se não quiserem ganhar uma granda dor de cabeça é converter. Vejam a seguinte hiper-ligação se quiserem saber mais um pouco sobre isto.
Para eliminar os itens recentes, por exemplo no VLC, antes que a tua mulher veja que andaste a ver filmes que não devias (:P), faz o que está descrito no artigo "Clear and disable recent items in Lion's Dock":